Selon Maurice Genoudet, le pont de l'Affaitioux (parfois dit de la Samaritaine du nom de la place proche, actuelle place Jules Girod) est bâti dans la deuxième moitié du 15e siècle par la famille Girod, qui exploite alors les moulins établis à proximité. Il est reconstruit après la crue extraordinaire de 1752 puis de nouveau en 1792 (1795 ?), par l'entrepreneur Pierre-Alexis Girod : comme les autres ponts en bois, il doit être réparé tous les dix à quinze ans et rebâti régulièrement. En 1866, l'architecte Ernest Guillaume constate : " Le pont en bois de l'Affétieux [sic] établi sur la rivière de Bienne, à Morez le Bas, est arrivé à un état complet de pourriture, à ne pouvoir se supporter lui-même qu'au moyen d'étais. " Guillaume propose de le déplacer de quelques mètres en amont de son emplacement initial pour le reconstruire, en pierre, perpendiculairement à la rivière et avec une pente moins prononcée. Les travaux, d'un coût de plus de 10 000 F, sont adjugés le 10 juin 1867 au maître maçon morézien Jean Chaussemy. La réception provisoire est prononcée le 5 septembre 1868, celle définitive le 23 septembre 1869. En 1984, le tablier est refait et élargi par l'entreprise Georges Tonetti, de Montmorot (33 rue Aristide Briand), assistée par la Société jurassienne d'Entreprise (de Messia-sur-Sorne).