Eglise de la fin du 12e siècle.
Les documents d'archives nous informent sur les différentes étapes de reconstruction au 19e siècle. D'importants travaux de réparations sont votés en 1832, d'après le devis de l'architecte Arnaud fils. L'adjudication a eu lieu en 1833 et le procès-verbal de réception des travaux de l'architecte Dorey-Maldant est daté de 1835 : remplacement des croisées du chœur, marche pour le chœur, réparation du tabernacle et des gradins de l'autel, appui de communion, peinture de l'autel.
En 1853, un devis de l'architecte dijonnais Girod est établi pour la construction d'une chapelle sur le flan nord. Un plan de 1860, par F. Goin, architecte-voyer, fait état de deux chapelles : une au nord (devis de 1853) et au sud, mention d'une chapelle "à construire".
Le clocher est modifié au 19è siècle : l'ajout d'une flèche, prévue en 1829, est ajournée , sans doute pour des difficultés financières, elle sera finalement construite en 1859. F. Goin en donne une description (devis du 12 février 1859- Archives départementales de la Côte-d'Or II O 479-7) : " Le clocher actuel de l'église de Pernand se compose d'une tour quarrée surmontée d'une toiture en lave portée sur deux pignons et percée à son sommet de quatre baies géminées. Le clocher ainsi que la majeure partie de l'église appartient à la dernière partie de l'époque romane [...] le revêtissement aurait lieu en tuiles vernies afin qu'il s'harmonise mieux avec le reste des constructions."
Un cahier des charges est établi en 1837 pour la refonte d'une cloche cassée (poids : 750 kg) ; refonte relancée en 1841.
Campagne de restauration en 1978, puis dans les années 2000, sur les toitures.
Pierre-Marie Barbe-Richaud, photographe. Région Bourgogne-Franche-Comté, Service Inventaire et Patrimoine, 2008-