L'église existe depuis 1443 sous le vocable de Saint-Cassien, 5e évêque d'Autun. Une première église, dont aucune description n'est connue, existait à Savigny dès les premiers siècles de la foi chrétienne. Cette église fut gravement endommagée avant le 11e siècle, peut-être au cours de l'invasion hongroise. Au cours de travaux, un nombre important de pierres noircies ou calcinées, provenant sans doute de la première église, fut retrouvé et remployé pour édifier l'infrastructure du clocher datant de la seconde moitié du 12e siècle. Il est construit en tuf de rivière et est de style roman ; sa base est carrée avec baies géminées, la flèche est octogonale. Il existe à Gênes une église Saint-Jean dont le clocher ressemble à celui de Savigny.
La nef et les collatéraux ont été agrandis au 18e siècle. Au début du 19e siècle (1810), des tirants métalliques sont venus consolider les murs et empêcher tout écartement. La porte date de 1930. Elle est en bois, de style Louis XVI. Son dessin est dû à l'artiste beaunois Émile Goussery.
Pierre-Marie Barbe-Richaud, photographe. Région Bourgogne-Franche-Comté, Service Inventaire et Patrimoine, 2008-