L'abbé Courtalon, curé de Rougemont de 1897 à 1926, poursuit les travaux de restauration de l'église entrepris par son prédécesseur, l'abbé Jean-Baptiste Renaud. Pour les mener à bien, il adresse une lettre à ses paroissiens dans laquelle il en énumère la liste, reprise par Robert Bichet dans son ouvrage Histoire de Rougemont. Il mentionne notamment le maître-autel de style roman, en pierre avec colonnes en marbre rouge, coûtant 3 200 francs. Les travaux sont menés en 1902 sous la direction de l'architecte Burcey. Le maître-autel a été mutilé dans les années 1960 à la suite des prescriptions de Vatican II. Il ne reste plus, sur place, que le gisant signé du sculpteur Jules-Aimé Grosjean et les deux anges déplacés dans la première chapelle du bas-côté droit. On ignore ce que sont devenus les deux gradins d'autel et le tabernacle.