La construction du barrage et de l'écluse de Verdun-sur-le-Doubs a été financée grâce aux fonds alloués par la loi du 19 juillet 1837. La Situation des Travaux de 1841 et de 1842 rappelle que le barrage de Verdun (1841) et son écluse fermant l'ancien bief de Verdun, et situé légèrement en aval de l'embouchure du Doubs, n'est pas accompagné d'une dérivation, contrairement aux autres ouvrages liés à la canalisation de la petite Saône.

La création de la Grande Écluse de Verdun, inaugurée en 1931, n'a pas modifié l’extrémité aval du bief. C'est le passage au grand gabarit qui a modifié le tracé de cet ancien bief : l'écluse de Charnay a en effet été remplacée par celle d’Écuelles et les écluses de Verdun ont été abandonnées lorsque le barrage qui leur était associé a été détruit en 1987.